Организация исполнения трудового законодательства Российской Федерации на территории области ведется по следующим основным направлениям: 

• формирование нормативной правовой базы в сфере трудовых отношений и иных, непосредственно связанных с ними отношений;
• государственное управление охраной труда;
• государственная экспертиза условий труда;
• организация социального партнерства, разрешение коллективных трудовых споров;
• регистрация соглашений в сфере социально-трудовых отношений и контроль за их исполнением;
• координация внутриведомственного государственного контроля за исполнением норм трудового права;
• консультирование по нормам трудового права работодателей и работников;
• мониторинг выплаты заработной платы, уровня доходов и заработных плат, условий труда, производственного травматизма.

Для регулирования социально-трудовых отношений на областном уровне по решению сторон социального партнерства создана областная трёхсторонняя комиссия по регулированию социально-трудовых отношений, которая состоит из 30 человек — представителей областных объединений профсоюзов, работодателей, Правительства области (по 10 человек от каждой стороны).

В соответствии с законом области «О прожиточном минимуме в Вологодской области» ежемесячно производится расчет величины прожиточного минимума в среднем на душу населения и по основным социально-демографическим группам. Величина прожиточного минимума утверждается ежеквартально постановлением Правительства Вологодской области.

Проводится ежедекадный мониторинг задолженности по выплате средств на заработную плату в организациях области.

Организована работа комиссии по установлению трудового стажа работников в связи с массовой утратой работодателями трудовых книжек в результате чрезвычайных ситуаций.

В рамках формирования социального заказа ежегодно проводится мониторинг потребности работодателей области в квалифицированных рабочих и в специалистах со средним профессиональным образованием.

Для оценки состояния трудового потенциала в прогнозном периоде и объединения всей имеющейся информацию о рынке труда области разрабатывается баланс трудовых ресурсов.

Для повышения уровня знаний по вопросам охраны труда в области сформирована система обучения и проверки знаний по охране труда руководителей и специалистов, в которую входят обучающие организации, имеющие лицензию на право проведения обучения по направлению «Охрана труда».

С 2008 года департамент ведет сотрудничество с Международной организаций труда (МОТ). Основная задача проекта — обобщить результаты и опыт работы по улучшению условий и охране труда, проанализировать его и создать благоприятные условия для их эффективного применения и развития в современных условиях.